1. Инструмент автоматической увязки примыканий работает для построения простых примыкающих трасс к основной дороге. Вы пытаетесь построить сложный перекрёсток между двумя 4-полосными трассами с разделительной полосой. В этом случае Вам необходимо запроектировать сложный перекрёсток, продумать схему движения и увязать всё вручную (с использованием инструмента "Увязка линий трассы").
2. Здесь тоже придётся увязать руками. У Вас не совпадают модели поперечных профилей. Например, непонятно что делать с линией «газон 3» на главной трассе. Автоматически программа может увязывать только совпадающие имена линий, иначе она не понимает какую линию с какой увязывать.
3. Лоток и бордюр Вы добавили в качестве элемента дорожной одежды. Они никак не влияют на проектную поверхность, которую нужно проектировать в редакторе проектной поверхности. Поэтому, если Вы хотите, чтобы отображались отметки по всем изгибам бордюра и лотка, то необходимо добавлять сегменты (что Вы и сделали). Но подумайте, правильно ли у Вас опускается отметка проезжих частей на высоту бордюрного камня разделительной полосы?
4. Лоток можно запроектировать по аналогии с трапециевидным кюветом.
На рисунке показан скорректированный вариант поперечного профиля.
Хотя, конечно, в каждом случае проект индивидуален и, возможно, Вам без дополнительных сегментов не обойтись.
P.S. C такими обширными вопросами лучше писать нам на support@indorsoft.ru.